Hola:
En el navegador no pueden hacerse llamadas a php, las únicas posibilidades que tienes es acudir al server tanto recargando la página (con un link o un formulario), o mediante ajax... y una tercera opción es pasar esos array a javascript y no hacer esa recarga... según el peso de esos arrays, y su dinamismo, puede ser esta tercera opción la más aconsejable.
Saludos