Fijate que... veo tu pagina y trato de entender lo que quieres, pero... aun no entiendo que es lo que quieres!
La parte ya mencionada? cual es la parte mencionada?
Si lo que quieres es que tu logo se quede
dentro de el cuadro rojo, simplemente hay que anidarlo, veo que tienes un div solo para el logo, que no lo veo mal, pero no lo veo necesario.
Simplemente puedes hacer un header, y ahi poner como background una imagen que contenga tu logo. Bajo ese header, puedes poner dos columnas, y tu web quedara perfecta!
