El que use yo funciona, verifica si esta bien colocado tu estructura:
el mio mi codigo.php que genera el pdf, esta 1 carpeta antes de la libreria
CArpeta_Libreria
codigo.php
Código PHP:
<?php
require_once('./Libreria_html2pdf/html2fpdf.php');
.
.
.
.
?>
y la forma como le llame era poniendole "
." (un solo punto antes de la direccion)
a mi me funciono perfecto, siguiendo todo esos pasos.
ya me es raro que no te funcione
salu2