en PHP5 no se usa mas <? ?>, proba de poner <?PHP ?>
Osea, que tu codigo quede asi:
Código HTML:
<html>
<head>
<title>Estados de México</title>
</head>
<body bgcolor="#FFFFFF">
De que estado te gustaría conocer su capital?
<?PHP
$Estados=array(1=>"Colima","Jalisco","Sinaloa");
echo "<form method=post action='capital.php'>";
echo "<select name='estado'>";
for ($counter=1; $counter<4; $counter++)
echo "<option value=$counter>$Estados[$counter]</option>";
echo "</select><br><br>";
echo "<input type=submit>";
echo "</form>";
?>
</body>
</html>