ese es el problema...
Código:
c:\appserv\www\php\functions\foo.php
c:\appserv\www\php\source\PcenMain.php
Código PHP:
include '../functions/foo.php'; // esta mal
include '../../functions/foo.php'; // OK :P
en el primer ejemplo, esta mal la ruta... ya que
../ solo permite subir un nivel a la ves...
cuando, realmente necesitas subir dos niveles... primero a
source/ y una ves mas hasta
php/
listo!