Asi es, llamas al interprete de PHP y abres el archivo que quieras.
Dentro de el archivo php que se va a ejecutar, creas tu consulta y todo lo que desees que haga el script.
Seria:
Cita: /ruta/hacia/php.exe -f /archivo/cronjob.php
http://www.adminschoice.com/docs/crontab.htm