Asignación dinámica de ids de variables

[yeudiel]

$_GET lo que hacees recoger valores enviados desdse un form o desde soquets, a menos q no sea asi, no lo uses.
en $puesto debes poner una cantidad fuera del bucle de preferencia, por ejemplo si tienes 50 puestos debe de quedar asi, $puesto=50;
si lo obtienes de una base de datos podria quedar asi $puesto=mysql_num_rows($result);

for ($i = 1; $i <= $puesto; $i++) {

$v_denominacion[$i]="denominacionPuesto".$i;
$puesto =$v_denominacion[$i];
$sql="INSERT INTO empresas.puestos_epes_accexp (denominacion) VALUES ('".$puesto."')";
mysql_query($sql,$link) or die ("fallo en la insercion");

}

Ademas que no entiendo tu codigo, podrias postear la tabla y te puedo ayudar mas