Yo en realidad nunca he usado los comentarios condicionales, bueno es que no acostumbro a hacer diseño, pero creo que puedes hacer algo asi:
Código html:
Ver original<!--[if IE]>
// aqui llamas a tu hoja de estilos
<![endif]-->
De todas maneras te recomiendo que preguntes en el foro de HTML o de CSS que tenemos aqui, que es en realidad donde debes preguntar.
Saludos y suerte