Gracias por las respuestas, imagine que el problema era ese. Pero lamentablemente no puedo modificar los parametros de otro_objeto.d, ya que es una funcion de jquery que no puedo modificar cuando la instancia y los parametros que le pasa. 
Pero igual encontre la solucion haciendo esto:  
 Código PHP:
    function A(){
  var manage = this;
  this.b = 0;
  this.c = function(){
        otro_objeto.d(function(){
                 manage.b = 1;
        } );
    } 
} 
    
  No se por que pero parece funcionar bien con una instancia de A.  Pero intuyo que no será asi cuando tenga varias.