Hola te comento a que es debido el famos autorun.inf, se produce debido a una ejecucion de codigo arbitrario en toda maquina Windows con tan solo pinchar un pendrive y acceder a el.
Descarga este archivo que te subo, lo ejecutas y aunque desabilites el autorun desde las directivas de usuario, lo que hace es evitar que se pueda ejecutar el codigo que te indico arriba.
Pruebalo y me cuentas.
http://www.speedyshare.com/725337718.html
Otra opcion para eliminarlo facilmente es desde Linux, ya que no se ejecutan.