arrancar .exe en el servidor

[celtica]

hola! mi problema esque tengo que hacer una pagina en la que el usuario rellene un formulario con 3 datos diferentes y cargue 2 archivos, una vez echo esto debe arrancar un archivo (en mi caso matlab).exe en el servidor para que este exe me genere un archivo xml en el mismo servidor y de alli googlemaps me lo cargue.
la parte del formulario ya la tengo completada, pero con el matlab no hay manera, de momento lo que hago es arrancar el matlab.exe en mi ordenador y subir ese archivo .xml que me genera,
alguien sabe como puedo hacer para que mi archivo .exe arranque en el servidor?? sin que el usuario se lo tenga que descargar ni nada por el estilo, simplemente que le de a un boton con el que empiecen los calculos y a generarse el fichero en el propio servidor.
gracias
un saludo