En el pasado yo buscaba algo similar. Necesitaba que una aplicación de escritorio, que con solo instalarla, se instalara mysql automaticamente. Nunca lo logré, pero según entendí, este proceso debe hacerse con una base de datos incrustada. (embedded DB).
Retomando un poco el tema con tu pregunta, me encontré con esto:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...installer.html
No lo he probado, pero podrías mirar las opciones que te dan los paquetes essentials y complete.
Si tienes éxito, comentalo. Es un tema muy interesante.
Un saludo.