Era cuestión de tiempo (casi 37 minutos), he aquí el resultado que me ha dado el cliente MySQL:
Código:
(1 row(s) affected)
Execution Time : 00:36:54:766
Transfer Time : 00:00:00:000
Total Time : 00:36:54:766
12,3 horas si inserto el millón de registros que tenía pensado.