Puedes usar el signo de ? para que una parte sea opcional. Fíjate:
Código:
RewriteRule ^([^/]+)/?([^/]+)?$ index.php?var1=$1&var2=$2
Capturaría:
w3.pagina.com/seccion/parte ( w3.pagina.com/index.php?var1=seccion&var2=parte )
Como también:
w3.pagina.com/seccion ( w3.pagina.com/index.php?var1=seccion&var2= )