Claro te agarra el ultimo registro por que es lo ultimo que contiene la tabla..
pero que quieres hacer? si es que cuando se seleccione una opcion me vaya a otra pagina con el id de esa opcion podes hacer algo como lo que tienes y lo envias por get o por post
Código PHP:
<a href="usuarios/ip_usuario.php?id=<? echo $row['codigo_empresa']; ?>
y en la otra pagina lees el id y haces lo que quieras..