Tendrías que recomprimirlo. Los cortes sólo los puedes hacer por unos frames especiales que se llaman keyframes. Si te fijas el virtual tiene unos botones que aparecen unas llaves amarillas o algo así, eso lo que hace es ir seleccionando los keyframes del vídeo, por tanto lo único que tienes que hacer es buscar un keyframe y meter el hacha ahí...
Si aun así quieres cortar por otro lado, puedes hacerlo, pero no podrás guardarlo en direct stream copy, sino que tendrás que recomprimirlo...
