Es lo mismo que pasa con muchas otras directivas que quedarán obsoletas en PHP6, como
magic_quotes o
register globals. Pensadas inicialmente para
facilitar las cosas, luego se vio que creaban más problemas de los que solucionaban. El usarlos nunca fue la forma correcta de escribir un programa en PHP, sino una forma fácil y simplista. Todos los scripts que se fien de ellas pues simplemente quedarán obsoletos o con deficiencias a partir de PHP6.
Por eso, como todos ya dijeron, es mejor programar como debe ser. Unas cuantas letras de más no afectará nuestra productividad, pero vaya que nos evitará horas de problemas al momento de migrar de servidor o rediatribuir alguna aplicación.