Cita:  
					Iniciado por jurena  
  INNER JOIN `conceptos` conceptos ON solicitud_viat.`Folio_solicitud` = conceptos`Folio_justif`,
 `justif_gastos` justif_gastos
where solicitud_viat.`Folio_solicitud`=2
 
el problema lo tienes con lo que hay en negrita. No sé si quieres usar el AND, pero debías decirnos qué relaciones buscas.
 
INNER JOIN `conceptos` conceptos ON solicitud_viat.`Folio_solicitud` = conceptos AND tabla.Folio_justif =
`justif_gastos` justif_gastos
where solicitud_viat.`Folio_solicitud`=2
 
Me he liado un poco con los nombres de campos y tablas, pero esa coma escrita hace que el inner join se haga con dos campos en modo OR.
Usa alias y escribe la tabla y su campo separados con punto y con el orden tabla.campo
 
Revisa un poco y vuelve a probar.
    Perdón por lo de las tablas no sabía que se iban a ver así las pongo otra vez 
SOLICITUD_VIAT  
Id_empleado  
Origen  
Destino 
Dia_inicio 
Mes_inicio 
Anio_inicio  
CONCEPTOS
Id_concepto
Folio_justif
Concepto
Cantidad
Porcentaje_iva
Iva_cant 
EMPLEADOS
Id_empleado
Nombre 
Listo y no se si me podrías explicar otra vez lo de la coma, verás este query lo estoy haciendo para un reporte con ireports y usé el diseñador de querys porque no tengo muchos conocimientos en mysql y el diseñador me puso así la consulta 
Gracias