Eliminar registros en un txt

[saczres]

buenas, ando trabajando con un archivo .txt y tiene infinidad de lineas.
bien kiero eliminar alguna de esas lineas k tienen cierto codigo, cuando le doy a reemplazar esa linea por nada, me deja en su espacio una linea en blanco, alguien sabe como acer ese reemplazo para k te suprima esa linea en blanco...un saludo

..tb me gustaria saber como poder reemplazar los puntos(.) por una coma(,) ya que en el note pad el punto representa cualquier caracter al buscar..un saludo