ok pues si puedes usar fpdf para generar tus reportes en pdf y asi lo puedes guardar desde el mismo script con el que generas el pdf o mediante el acrobat cuando generas el reporte asi mismo mandarlo a imprimir desde ahi, bueno si eso es lo que quieres primero empieza por ver la
web oficial de fpdf y estudiar el
tutorial que se encuentras ahi mismo, en ese tutorial dan un ejemplo de como implementar los encabezados y pie de pagina