Yo lo solucioné de esta forma:
oFCKeditor.Value = '<?php echo preg_replace("(\r\n)", "", $descripcion); ?>';
bueno te comento que de la primer forma funciona ...
de la segunda no ...
yo lo logre con un mix entre las dos jejej
$content = $texto;
$sustituye = array("(\r\n)", "(\n\r)", "(\n)", "(\r)");
$content = preg_replace($sustituye, "", $content);
