es como lo digo, en mi caso, acceso a phpmyadmin desde el panel de control de mi host (cpanel) por lo que requiere logicamente el previo login a cpanel, de esta manera nadie puede accesar desde afuera con algo como
www.misitio.com/phpmyadmin/
supongo que tu preocupacion surgia por que tu tienes instalado phpmyadmin en los archivos de tu sitio, o sea, cualquiera puede acceder desde
www.misitio.com/phpmyadmin/ mi recomendacion en este caso es que le pongas usuario y password desde el .htaccess a ese directorio y que usaras un buen password para root en mysql