Puedes utilizar arrays mira aqui dejo un ejemplito de como para que te des una idea
Código PHP:
if(isset($_POST['alumnoID'])){
$n = count($_POST['alumnoID']);
for($i = 0; $i < $n; $i ++){
echo "El alumno numero " . $_POST['alumnoID'][$i] . " Obtubo un " . $_POST['nota'][$i] . "<br />";
}
}
?>
<form method="post" enctype="multipart/form-data">
<br /><input type="text" name="alumnoID[]" value="1" />
<input type="text" name="nota[]" />
<br /><input type="text" name="alumnoID[]" value="2" />
<input type="text" name="nota[]" />
<br /><input type="text" name="alumnoID[]" value="3" />
<input type="text" name="nota[]" />
<input type="submit" value="Enviar" />
</form>