aquí puedes revisar las opciones del TuneUp...
http://www.tune-up.com/products/tune...ties/features/.
otro programa recomendable (aunque con menos opciones) es el CCleaner...
http://www.ccleaner.com/.
sobre perder datos, programas, lo ideal es tener un backup de tus archivos y/o crear una imagen de tu disco incluido el SO y demás software, por defecto estos programas solo te borraran archivos temporales, entradas erróneas en el registro, etc, pero como trabajan sobre el registro de windows y tienen la opción de desinstalar programas, con un mal uso por parte del usuario no se descarta la posibilidad.