Configurar phpMyAdmin y llaves foraneas

[jaao_death]

Intenta revisar como hace PHPMyAdmin para reconocer este tipo de datos viendo su código.

Claro que ahora que lo pienso, Podrías hacer una consulta del tipo "SHOW CREATE TABLE" no estoy seguro de si funciona pues nunca lo he probado, pero puedes intentarlo, luego lo único que tendrías que hacer es procesar el resultado, así tendrás toda la forma de tu base de datos recorriendola con algún bucle y posterior mente procesando las tablas.
NOTA: no se si la estructura de la tabla te muestre las opciones de un campo foraneo.

espero que esto te sirva de algo...