Cita:
Iniciado por David el Grande 
Es que con sólo poner rel="shadowbox" no es que automáticamente ya funcione. Debes nuevamente lanzar la función (normalmente es init() o algo así) que asigne el comportamiento deseado a los enlaces.
Mmmm-... cuando esa página se inicia ya tiene en el init() la inicialización del objeto...
por eso, pense que como tan solo hace un replace del contenido de un div, no hacía falta inicializar nada...
entonces, aunque ejecute un innerHTML para que el objeto actue sobre ese link con el rel="...." he de volver a lanzar la función de inicialización?