Hola a todos.... Jasso, yo lo que hago a veces (prefiero hacerlo a mano) es usar el Photoshop elements, puedes bajar una versión de prueba directo desde su web site, te dejo un link para que veas los resultados, dependiendo las perspectivas y los puntos de fuga, los resultados llegan a ser sorprendentes, ya que el programa por si sólo los arregla, además de corregir la intensidad de luz y tonos... Con un set de imágenes viniendo de y un scanner flatbed con la aplicación que dices no debes tener ningún problema.
Espero te sirva.
Saludos
photoshop elements