Si estas en una pagina que ya tiene menús, barra de direcciones, botones de Regresar/Adelante, etc. no puedes hacer que desaparezcan, debes redireccionar a una nueva que sea creada originalmente con las propiedades de un popup:
Código PHP:
$url="nuevapagina.php?codigo3=$codigo2";
print('<script LANGUAGE="JavaScript">
ventana= window.open('.$url.','ventana','width=400','height=600',titlebar=no,resizable=no,scrollbars=yes,dependent=true');
</script>');
Eso, según lo que entendí de tu consulta