se puede contar filas escluyendo algunas segun condicion?

[diegomel]

Hola, tengo el siguiente problema a ver si se puede hacer.
Yo tengo lo siguiente:
$sql_1 = mysql_query("SELECT sbacriad.*,sbapropi.* from sbacriad INNER JOIN sbapropi on sbacriad.PROPI=sbapropi.NUMERO where haras like '$busqueda%'") or die(mysql_error());
$total_registros = mysql_num_rows($sql_1);

que uso para sacar el total de registros para luego paginar, ahora el problema es que yo en la impresion de datos tengo que excluir aquellos datos que tengan como condicion que la fecha_baja sea != a null, osea no mostrarlos. esta parte la tengo armada con un if, el problema que tengo es que al hacer la cuenta en esa query hace el total de filas la cuenta entonces cuando pagina el resultado total no es igual al de datos motrados y por lo tanto no coinciden, hay alguna forma de contar filas pero con la condificion de excluir datos para sacar el total real?.
Espero que se haya entendido lo que necesito.
Saludos y gracias.