Problema con copias de seguridad

[Ignatius2]

Hace un mes me compre un disco duro externo mas que nada para hacer una copia de seguridad de los archivos de mi pc. Como ya hacia un mes desde que hice la primera copia, ayer me dispuse a hacer una nueva y cual fue mi sorpresa al cabo de un rato en que me aparece un mensaje diciendo que no habia suficiente espacio libre en el disco duro del pc (boot) y que la nueva copia no se podia realizar. Esto me sorprendio' por dos motivos, el primero que no sabia que habia que tener espacio libre en el pc para hacer una copia, ya que lo logico es que eso sea necesario en el destinatario de la copia (en este caso el disco duro externo). El segundo motivo porque me sorprendio' esto es que juraria que tenia antes de hacer la copia unos 3 gigas libres en el pc...
el caso es que hoy me he asegurado que tenia espacio libre (mas de 5 gigas) borrando cosas o pasandolas al disco duro externo, y me he dispuesto a intentar una nueva copia de segurirdad. al principio, durante un par de horas, parecia que la copia se realizaba correctamente, pero un rato despues me encontre' con el mismo mensaje de que no se a podido realizar por falta de espacio en el boot...¡y mis 5 gigas encima han desaparecido!. Agradeceria mucho que alguien me ayudara a comprender esto e intentar solucionarlo.
Gracias.