Simple, aver lo que tienes que hacer es tener un index.php con sentencias de control como switch o simples if,elseif y else
yo personamente utilizo switch
Código PHP:
<?
switch ($modulo)//Esta es la variable que ira cambiando dependiendo del enlace
{
case inicio://En caso de ser index.php?modulo=inicio, incluimos inicio.
include("inicio.php");
break;
case mail:
include("mail.php");
break;
default://Y por defecto no incluye inicio.php
include("inicio.php");
}
Y ese es todo el codigo.
y en los enlaces tendrias qur poner algo asi
Código PHP:
<a href="index.php?modulo=inicio">Inicio</a>
Y listo espero te quede claro