Crea un contador.
Código PHP:
$agentes = array("Manzana","Pera","Banana","Pepino","Durango","China","Naranja","Juelas","China1","Rulo","Habic","Uva");
$Contador = 0; ## Contador
foreach ($agentes as $id){
if($Contador == 4){
echo '<br>';
$Contador = 0;
}
echo $id." ";
$Contador++;
}