Mira si quieres tener un video WMA, lo puedes hacer eso si te ne cuenta que es mas robusto este tipo de archivos (pesan más) además al igual que el flv requiere de una cierta velocidad de transmisión para que sea vean bien y no haya perdida de calidad.
Y en youtube si no tienes instalado el reproductor para flash, la misma página se encarga de direccionarte a la página de adobe para que bajes el reproductor, generalmente la maypría de las pc ya tienen instalado este soft, si no es solo cuestión de meterte a adobe y en descargas ahí esta dicho programa.
http://get.adobe.com/es/flashplayer/