Podrias utilizar jquery tmbn.
ejemplo: Código HTML:
<html>
<head>
<?php
setcookie("capa","capa2",time() + (3600*3));
?>
<title>Mostrando capas css</title>
<script type="text/javascript" src="jquery-1.3.2.js"></script>
</head>
<body>
<div id="capa1">
<p>Esta la capa numero 1</p>
</div>
<div id="capa2">
<p>Esta es la capa numero 2</p>
</div>
<div id=”capadefault”>
<p>Esta es la capa default</p>
</div>
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function()
{
<?php
$micookie = $_COOKIE['capa'];
if ($micookie == "capa1")
{
echo '$("#capa2").hide();';
echo '$("#capadefault").hide();';
}
elseif ($micookie == "capa2")
{
echo'$("#capa1").hide();';
echo '$("#capadefault").hide();';
}
else
{
echo '$("#capa1").hide();';
echo '$("#capa2").hide();';
}
?>
});
</script>
</body>
</html>