Que tal, al ver tu pagina pude observar a simple vista que es un error de LOOPEO, tenes algun While, algun Do, que no está saliendo.
Por lo que aunque pudieras configurar el PHP.ini lo unico que harias es aumentar el tiempo del error y esa no es una solucion.
Por lo que te aconsejo que mires en tu codigo algun bucle y que debugues tus archivos a puros ECHOS y DIES para que puedas ver que está sucediendo.
Saludos
