2 dominios apuntando a una misma cuenta de hosting

[Ronin46]

Ya, eso sí, pero también va por el tema de que si accede a la raiz del primer dominio va a acceder al segundo dominio, entonces en los buscadores, el segundo dominio, aparte de aparecer por si mismo, aparecerá como incluido dentro del primer dominio

Veamos, yo entiendo que en un hosting haya varías cuentas, tal que:
- Dominio1.com/public_html
- Dominio2.com/public_html
- Dominio3.com/public_html
- ....
Es decir, juntos pero no revueltos, cada uno nada tiene que ver con el otro

Pero en este caso es:
Dominio1.com/public_html/Dominio2

Entonces si yo en el dominio2 tengo una página que se llama abc.html, la página será indexada dos veces:
Forma 1 - dominio1.com/dominio2/abc.html o bien dominio2.dominio1.com/abc.html
Forma 2 - dominio2.com/abc.html

Contenido duplicado no va a ser, eso me queda claro, pero tampoco queda muy bien que lo indexe como la forma 1, de ahí que igual sea mejor poner en el robots.txt del dominio1.com una línea para que excluya dominio2.

Bueno, por lo que veo es más una cuestión psicológica mía de si me gusta que un dominio sea indexado "dentro" del otro o mantenerlos diferenciados, que una cuestión técnica de cara a los buscadores.