Eso es muy personal boredes... yo por ejemplo tengo mi prioridad de booteo la disketera, despues la lectora y despues el disco rigido, ya que si queres arrancar un live CD de linux por ejemplo (o cualquier CD booteable), si tenes como prioridad el disco rigido nunca te va a bootear, pero depende de cada uno... vos fijate en base a tus necesidades.
Espero que te haya servido el pequeño aporte, un saludo che!, mucha suerte!