Restar en Mysql

[gnzsoloyo]

Voy a hacer una hipótesis basado en lo que describes en el primer post (que resulta algo confuso):
1) Las dos tablas contienen una direccion URL de una página a la cual tu web está elacionada de alguna forma. El como es irrelevante a nivel de bases de datos.
2) En una tabla conservas la información de visitas originadas por esa web a tu web; en la otra las visitas originadas a esa web desde tu web.
3) Cada registro corresponde a un sólo día, por lo cual el campo de sumatoria de visitas se refiere a las visitas realizadas en una u otra dirección el mismo día.

Si lo que quieres es establecer el saldo a favor o en contra de las visitas desde y hacia esa web (listando todas las web donde la idea es la misma), la consulta sería algo así:

Código sql:

SELECT 
    in_direccion URL, 
    in_contador ENTRANTES, 
    visitas SALIENTES, 
    (in_contador-visitas) SALDO, 
    in_fecha FECHA
FROM contador C LEFT JOIN `out` O ON c.in_direccion = O.url AND C.fecha 
= O.fecha
ORDER BY URL ASC, FECHA ASC, ENTRANTES DESC, SALIENTES DESC, SALDO DESC;
 

Si, en cambio, quieres saber el total de visitas desde y hacia y su saldo, sin discriminación de fechas, hay que hace algo más complicado:

Código sql:

SELECT URL, ENTRANTES, SALIENTES (ENTRANTES-SALIENTES) SALDO
FROM 
  SELECT 
    in_direccion URL, 
    SUM(in_contador) ENTRANTES, 
    SUM(visitas) SALIENTES, 
    in_fecha FECHA
  FROM contador C LEFT JOIN `out` O ON c.in_direccion = O.url AND C.fecha 
= O.fecha
GROUP BY URL) TABLA1
ORDER BY URL ASC, FECHA ASC, ENTRANTES DESC, SALIENTES DESC, SALDO DESC;
 

Habría que probar...