Si quieres pasar esos .flv a otro formato como .avi, .mpg o algun otro te recomiendo el "super" de erighsoft es un reconvertidor muy estable que te permite manejar varios formatos de video y diferentes byterates.
Te dejo un enlace:
http://www.proimagen7.com/2007/05/vi...dor-super.html
Recomendaciones: lee bien la página para que sepas como abir el archivo y el códec que necesitas para abrirlo.
Otra opción es que te bajes los códec ffdshow para visualizar archivos .flv igual te dejo un enlace para descargar y confogurar estos códecs:
http://www.mundodivx.com/descargas.php?id=28