Eso pasa porque en ambos documentos estas enviando cabeceras html y cierras inmediatamente despues:
Código php:
Ver original<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<script src="TreeMenu.js" language="JavaScript" type="text/javascript"></script>
<link href="css/css_arbol.css" rel="stylesheet" type="text/css" />
</head>
<body>
<div class="arbol">
<?php $treeMenu->printMenu()?>
</div>
<div class="logo"><img src="images/NuevoLaredo.png" width="200" height="80"></div>
</body>
</html><!-- Todo lo que venga despues de esto ya no aparecerca -->