A mi en lo particular me gusta un poco más la intefaz ahora, aunque para serte franco si me ha costado un poco adaptarme a andar buscando todo en cada pestaña.
Lo de tu problema me parece que está bien hecho el procedimiento, faltaría solamente indicarle en la numeración de la segunda sección (en encabezado o en pie de página según donde lo pongas el número) que sea distinta de la primera sección. Así de alguna manera se independizan las numeraciones y lo que hagas en una no afecta a la otra.
chécate esto
http://www.forosdelweb.com/f90/salto...2007-a-646149/