Ese es el problema de haberlas pasado como htmlentities debiste hacer uso de
mysql_real_escape_string. Te sugiero que almacenes las información usando esta funcion que te indique ya que hacer una busqueda usando LIKE "%string%" siempre te va a traer todos los acu que existan. Si el editor ya viene de esa forma, usa
html_entity_decode para convertirlas normalmente y luego usa mysql_real_escape_string para ingresar la informacion a la base de datos.