Hola,
mira he estado mirando tu tema, y he visto que hay algunas extensiones de Joomla, que sirven para subir archivos, son bastante completas, ¿podrias probar y nos cuentas? te paso los link de dos que he visto:
Attatchment
Flash Uploader Plugin
Hay muchas mas aqui, se llamaN extensiones UPLOAD
http://extensions.joomla.org/extensi...ile-management
Si sigues sin ver nada que te valga, alomejor te viene bien este codigo, que es en php y lo que hace es como Gmail, envia archivos.
http://www.buayacorp.com/archivos/en...-estilo-gmail/ http://www.buayacorp.com/files/php/uploader.php
Espero te ayude algo!, mucha suerte