No es necesario hacer que el menu sea transparente basta con hacer que parezca transparente, haces tu diseño en Photoshop con esa transparencia y asi lo cortas y lo maquetas.
Si deseas algo más elaborado puedes usar un PNG 24 bits como fondo del menu (ojo no funciona en IE6 ni aun usando alguno de los hacks ya que estos no funcionan bien con links)
Y te quedaría algo como lo que hice en
esta web, puedes ver el codigo fuente y graficos con firebug