No es que sea algo raro que se haya codificado, lo raro es que no lo hiciese cuando tu le haz mandado eso al script
http://us.php.net/manual/en/function.crypt.php
tienes que quitar eso para que no salga codificado, cosa que no te aconsejo, pero bueno... o usar el mismo método de encriptación antes de validar la contraseña que hayan introducido, para que así coincidan con el archivo.