Hola amig@, podemos descartar un problema de sobrecalentamiento del sistema ya que como comentas....
Cita: puede estar varias horas encendidas y la temperatura del micro se mantiene dentro de lo normal.
Aun asín para ir descartando, procede a sustituir la pasta térmica del micro......
Pero todo parece indicar que la anomalía proviene de la motherboard, ya que ademas has comprobado este con otro fuente de alimentación si resultados....