El codigo que has puesto no me da mucha ayuda, por lo que vi solo imprimes los datos de los alumnos con ese codigo, lo unico que te puedo decir de ese codigo es que no necesitas hacer esto
Código PHP:
<? echo $contador?>
y luego
<? $contador++?>
lo pudes hacer de una sola vez
<? echo $contador++; //imprime el numero y lo aumenta en uno
echo ++$contador; //al revez, incrementa en uno y luego imprime
?>
por otra parte, tmb usa las etiquetas de codigo php [ PHP][ /PHP], o html segun el caso, que un chin de letras no veo bien y ya me estoy quedando ciego
.
Para ayudarte necesitaria que pusieras el codigo que tienes cuando haces la modificacion
y esto?
<input name="codigo_asignatura" value="<? echo $_POST["codigo_asignatura"]?>" type="hidden" size="60" maxlength="60">, problema de copy-paste? un input type hidden no tiene size ni maxlength, no se ven y son ocultos al usuario