Puedes usar una condicion con mysql_num_rows() para ver si hay entradas, por ejemplo:
  Código PHP:
    <?php
$select = mysql_query("SELECT * FROM `articulos` WHERE seccion = ''");
if (mysql_num_rows($select))
{
 // codigo para mostrar el menu
}
else
{
 // otro codigo o dejar vacio si no hay entradas
}
?>