Para eso usas divs y CSS. Aquí tienes algunos ejemplos de diseños CSS:
http://www.maxdesign.com.au/presentation/page_layouts/
También mira este muy buen tutorial de Mikel de como migrar un website de tablas a css:
http://www.araudi.net/migracion/migr...sin_dolor.html
Otra cosa. Los templates de DW desde DWMX (creo) son hechos completamente en css, así que también puedes usar uno de ellos como punto de partida.