Bueno no se si te he entendido del todo bien pero creo que lo que podías hacer es lo siguiente. Con dom crearte un objeto TABLE cuando le des al botón, pillar los tr de la tabla en cuestion que quieres agregar y agregarselos a tu nueva tabla. Y luego meterla en un div aparte de donde ya tengas las tablas creadas. Por ejemplo, imagina que el div donde quieres mostrar las tablas se llama divTablas y que hemos pulsado el botón de tabla_2.
Código:
var divTabla = document.getElementById("divTablas");
// Creas la tabla que vas a mostrar.
var tabla_a_mostrar = document.createElement("TABLE");
listaFilas = document.getElementById("tabla_2").getElementsByTagName("TR");
while(listaFilas.length >0){
tabla_a_mostrar.appendChild(listaFilas[0]);
}
divTabla.appendChild(tabla_a_mostrar);
Creo que eso debería funcionar, al menos es una idea, se puede depurar, aunque no sé si es lo que buscabas.